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Desarrollo de tecnologías de secuenciación directa de ARN para la rápida detección y monitorización de cáncer
El diagnóstico temprano de cáncer está altamente correlacionado con una buena prognosis y mayores tasas de supervivencia de cáncer. Para aumentar la proporción de pacientes de cáncer que son diagnosticados en estadios tempranos de la enfermedad, es necesario utilizar herramientas que permitan la detección y monitorización de cáncer en biopsias líquidas.
En este sentido, el descubrimiento de ARNs pequeños (moléculas reguladoras de la actividad de los genes) pero estables en el plasma sanguíneo ha generado mucho interés en desarrollar métodos para poder cuantificarlos, ya que estos ARNs están típicamente alterados en pacientes con cáncer.
Por desgracia, todavía no tenemos un método simple, económico y de alta precisión que permita cuantificar estas moléculas en muestras biológicas.
En este proyecto, propongo establecer una nueva tecnología de secuenciación, la tecnología de nanoporos, para cuantificar las abundancias de ARNs pequeños en muestras biológicas, y usar inteligencia artificial para predecir si la muestra es “normal”, “cancerosa” o “metastásica”. Utilizando esta metodología, queremos determinar la malignidad de una muestra en menos de 3 horas, y por un coste no superior a 50 euros por muestra.